病毒檢測介紹

    病毒的構成只有一個蛋白質(zhì)外殼內(nèi)部包裹著DNA或RNA形成的一段序列,簡約的結(jié)構卻并不簡單。病毒是一種靠寄生在細胞內(nèi)部才能存活和復制的微生物,病毒畢生的故事就像一部情節(jié)老套的連續(xù)劇,從尋找宿主開始、到入侵宿主和自我復制、宿主破裂病毒釋放,到尋找下一任宿主,周而復始。病毒對宿主的選擇還特別的挑剔,一般來說一種病毒只會寄生在一種或幾種特定細胞內(nèi)。

    由于病毒入侵感染的細胞不同,因此進行病毒檢測時樣本取材的部位也不盡相同。例如乙肝病毒只寄生在肝臟細胞內(nèi),流感病毒只寄生在呼吸道的細胞內(nèi)。而這次引起**范圍內(nèi)流行的新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)就大量存在下呼吸道粘膜和肺泡組織液中,對于感染初期的患者來說,如果僅從血液樣本中是很難捕捉到新型冠狀病毒的蹤跡。

    對于人體來說,病毒是一個外來的“入侵者”,當病毒從破損的皮膚、粘膜、呼吸道、消化道等處入侵后,人體會產(chǎn)生一系列應激性的反應。病毒感染早期癥狀通常不是很明顯,隨著病毒不斷復制,數(shù)目顯著增加,會引起紅腫、潰瘍等局部炎癥,隨著病毒進一步增多,人體會通過咳嗽、腹瀉、發(fā)熱等向外排出病毒,抑制病毒復制,并激活體內(nèi)*反應,對入侵的病毒進行全面滅殺。

    那么如何才能對病毒進行有效的快速檢測呢?與細菌和寄生蟲等不同,由于病毒顆粒小,很難通過光學顯微鏡直接觀察,病毒載量高(通常大于107個)時通過組織切片樣本進行負染增強后,可使用電子顯微鏡觀測,但是通常到了這個時候,病人的“含毒量”也已經(jīng)很大了?,F(xiàn)在較常用的病毒檢測從方法學上主要分為核酸測定和*測定兩大類。

    在病毒感染早期,病毒數(shù)量很少,對于已知的病毒種類,核酸測定可以捕獲到病毒核酸特定的序列,從而抓住病毒入侵的“蛛絲馬跡”。但核酸檢測本身有很多步驟,從制備樣本開始,鼻拭子、咽拭子等樣本比血液樣本中含有更多雜質(zhì),成分也較加復雜,這些成分很多會抑制核酸檢測試劑,降低檢出率。因此需要去除雜質(zhì),將病毒的序列純化提取。核酸樣本儲存和運輸也是非常重要的環(huán)節(jié),比如新冠病毒是RNA病毒,而RNA不穩(wěn)定,非常容易降解,因此存儲條件至關重要。這些步驟中出現(xiàn)任何一個問題都可能導致病毒核酸無法檢出。

    *測定是一種間接檢測方法,主要是尋找針對該病毒的特異性抗體,以檢測抗體來代替直接檢測病毒。舉例來說,如果有人感染了麻疹病毒,且沒有接種過疫苗,那么身體里就會產(chǎn)生針對麻疹病毒的抗體。同樣,假設被新冠病毒感染,我們的身體也會產(chǎn)生針對新冠病毒的抗體。IgM是初次體液*應答中較早出現(xiàn)的抗體,是機體抗感染的“先頭*”,在感染的初期起作用但維持時間短、消失快。一般在感染新冠肺炎后的7天,發(fā)病3天左右,血液中就會產(chǎn)生特異性IgM抗體。將IgM抗體檢測和核酸檢測互相印證,就可以較大提高新冠肺炎的診斷率。而IgG抗體則產(chǎn)生較晚,但維持時間長、消失慢、濃度高,可作為遠期感染的指標。并且對于病毒**和疫苗研發(fā)的意義也非常重大。通過對恢復期患者血清中抗體提取和純化,可以有望尋找到對病毒有明顯抑制作用的“中和抗體”,這可以快速應用的臨床危重癥患者的**,也可以用于預防性疫苗的研發(fā)。

    無論是核酸檢測,還是抗體檢測,都是“有的放矢”,對已知病毒進行檢測。而高通量測序在病毒檢測,尤其在新病毒發(fā)現(xiàn)和鑒定中發(fā)揮著大作用。對于未知病毒鑒定來說,首先需要完成病毒的分離和純化,通過對未知病毒核酸序列進行測序和鑒定。通過對臨床病毒基因組進行連續(xù)分析,就可以跟蹤病毒隨時間的突變,這對揭示病毒在時空中傳播的偏好和特點,實時監(jiān)控病毒在易感人群中的傳播較為重要,也可以為公共衛(wèi)生干預手段提供信息,讓我們較好地知道病毒如何變異,如何傳播,從而讓我們較好地預測未來,并希望能預防病毒的進一步傳播。

    傳統(tǒng)的檢測方法是在實驗室中對病毒標本進行核酸擴增、凝膠電泳、*熒光標記等分析,隨著檢測技術的不斷發(fā)展,新的病毒檢測技術在靈敏度和準確性方面進行了很大提升。例如數(shù)字PCR、雜交捕獲*熒光、膠體金*分析、CRISPR(規(guī)律間隔成簇短回文重復序列)基因編輯技術、下一代測序等新技術不斷發(fā)展。

    快速、準確是檢測中較重要的兩個指標。目前發(fā)展前景較好的,是可便攜式的快速檢測技術,可以將病毒快速檢測部署到醫(yī)院甚至社區(qū)中。一體式的儀器可以在全封閉檢測芯片完成核酸提取及檢測,可適用于急診、ICU、救護車、社區(qū)、家庭、火車站等環(huán)境下快速識別感染人群,這為病毒防控提供了較有力的武器。


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